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所有人的视线全部落到了地球上，那股恐怖的力量爆发出来的时候就连战斗中的人们都不约而同得停了下来。
只见太平洋的海面上不知何时出现了一座遗迹。
而在那遗迹的正中央，已经恢复了自己原本身姿的黑暗扎基正单手掐住盖亚的脖子。艾克斯见此还想冲上去帮忙，可黑暗扎基仅用一个眼神就让艾克斯体内的大地动弹不得。
和黑暗扎基有过一次交手的银河在面对现在的扎基时也提不起什么反抗的心思。
……
……
时间倒回到【异形之海】时。
“你这个混蛋！你对艾莉做了什么！”
“嘘，不对不对不对~不是我对那只艾雷王做了什么事情，我做的这一切可都是为了你啊，我可爱的弟弟哟~”
话音落下的瞬间怜整个人都愣在了原地，淡黄色的眸子里满是不可置信，任谁来了都不会相信黑暗扎基说的话，可眼前的巨人随后说出的话却让他不得不相信。
“我想你应该看到了我给你留下的那份资料了吧，一切事情都要回到二十五年前，所有事情都还未发生的时候。”
随着黑暗扎基的话音落下，在怜的面前便出现了一面巨大的荧幕。
那是更加久远的历史。
在广袤的宇宙中，有一处M80天蝎座球状星云。和M78星云光之国一样，那里居住着一群智慧超绝的生命体。这颗星球和地球一样美丽的星球，在那颗星球上生活着一群外表类似水母的白色生物，过着平凡且和平的生活。可是随着异生兽的到来，一切美好全部都被打破了。
恐惧与绝望在那颗星球上肆意传播，异生兽在如此庞大的负面情绪的滋养下变得越来越强。
直到光芒的降临。
银白色的巨人来到了这颗近乎毁灭的星球之上，帮助它们将异生兽全部消灭。而在巨人离开之后，那颗星球上的人依旧没能从恐惧中走出，经历了几乎灭族的灾难之后所有人都害怕有一天会再次经历这一切。
正是这份恐惧，滋养了那些残余的异生兽的细胞，导致异生兽再次出现在它们的星球上。
好在它们以巨人为原型制造出了强大的生物兵器——也就是眼前的黑暗扎基。
那时候的扎基还不是现在的样子，无论是外观还是身体的数据都是仿照那位银色的巨人制造出来的。
所有的一切都是相同的。
那位巨人就是传说中的诺亚奥特曼，只不过那时候的诺亚并没有身后那双巨大的诺亚之翼。以诺亚为原型的黑暗扎基同样拥有着极其强大的力量，可是在和异生兽长久的战斗中，黑暗扎基慢慢的拥有了自我意识。
起初人们并没有意识到这件事。
拥有了自我意识的扎基
直到它们发现黑暗扎基开始和异生兽接触时，一切都已经晚了。黑暗扎基已经彻底的掌控了异生兽！作为这颗星球上最强的生物兵器，根本就没有任何能够直接消灭它的办法。
最终只能引爆星球，这才黑暗扎基的身体消灭。
……
……
四十年前。
在宇宙中不知漂流了多久的宇宙飞船来到了地球，这艘飞船的主人正是黑暗扎基的制造者。
被当时的地球人称之为来访者。
……
……
三十年前。
来访者在地球上发现了异生兽出现过的痕迹，那沉睡已久的恐惧再次冒了出来，为了防止地球被异生兽毁灭，也是为了它们能够在地球上生活下去。
来访者决定对地球进行科技援助。
在那段日子中，地球的科技实现了阶段性的突破，但是就只靠这些武器的话没办法给来访者足够的安全感。
于是乎……
生物兵器计划再次被提上日程。
但是黑暗扎基的先例就摆在眼前，这次的生物兵器绝对不能重现黑暗扎基的惨剧，怎样解决这个问题就成为了摆在所有人面前的一座无法跨越的大山。
焦虑和恐惧渐渐地在来访者中蔓延。
如果继续这样下去的话异生兽迟早会复活，直到五年后，诺亚沉睡的遗迹被发现，一同发现的还有两道未知的光芒。
而那就是地球的大地和海洋之光。
最后。
以三道光芒为基础，再加上只存在于某些人类中的特殊基因，也就是超古代战士的基因。将这些东西相互结合，最终诞生出了一个全新的生命体。
一个拥有人类感情的，完美的生物兵器。
也就是怜。
但是黑暗扎基以灵魂的方式来到了地球，它附身在某位研究员的身上等待着复活的时机。
而现在就是最好的时机！
只要夺取了这幅身体，将沉睡在这具身体当中的光芒全部转化为黑暗就能够它复活！
但是很可惜。
来访者们再次以生命为代价阻止了黑暗扎基。
它们引爆了研究所，爆炸产生的火焰几乎吞噬了一切。但尽管做到了这种程度，还是让黑暗扎基夺走了怜的部分光芒，让它再次拥有了实体化的力量。
也就是后来出现的黑暗梅菲斯特。
但还没等它高兴就被一柄利刃贯穿了胸膛：“阁下不是人，而且还有着如此邪恶的气，在下是绝对不会允许尔等肆意妄为的！”
随着话音落下，黑暗梅菲斯特变被一股强大的力量给封印到了地底当中。可这只不过是缓兵之计，在多年之后黑暗梅菲斯特便会冲破封印再次祸乱人间。
而能够解决这一切的人就是静静的躺在武士怀里的婴儿。
……
……
“那个被武士带走的婴儿，就是你！秋山怜！”
“所以呢？”
这个故事确实解开了怜很多的疑惑，但是那又如何？既然他是为了消灭异生兽而被制造出来的，那他就要履行自己的责任，将所有的异生兽全部消灭。
“既然你都说了我是来访者制造出来的生物兵器，那么消灭你就是我的责任。”
“话说的很好，但是就凭你现在狼狈的样子要怎么消灭我呢？我就是要让你看着，看着我是如何恢复自己的力量的。”
随后【异形之海】缓缓散去，重新回到了两人战斗开始之前的海底。
也就是封印着这颗星球上最恐怖的黑暗的地方——露露耶遗迹。